原发性生殖器疱疹是首次发病，易感染病毒的是三大黏膜和阴茎。医院在感染五天左右发病部位出现症状。男性的包皮、龟头、冠状沟，阴囊为主要发病部位，也可于肛门、直肠、尿道、精囊处发病，女性为大小阴唇、阴蒂、阴道、宫颈、尿道处发病，也多见于大腿和臀部发病。

　　原发性生殖器疱疹，患部初期感觉异常，有瘙痒，灼热，白带增多和异味等不适，很快局部出现淡红色斑，医院在红斑的基础上发生几个到十几个成群的伴有瘙痒的红色丘疹，并很快变成集簇的芝麻绿豆大小的水疱,水疱会逐渐变成脓包。通常脓包会溃破形成糜烂和溃疡面。伴有烧灼样的剧烈疼痛。溃疡结痂愈合后会有色素残留，病程持续15天至30天。

　　许多原发性疱疹患者，还伴有发热、全身不适、头痛、肌肉痛、股沟淋巴肿大症状，还有尿频、尿痛、排尿时生殖器疼痛等症状。女性患者90%左右子宫颈和外阴部同时病损，且多双侧病损，易合并尿道炎、排尿困难等症，有腥臊异味。